Utegångsförbud i delar av Kairo
Tusentals hade samlats i protest mot militären efter våldet i onsdags som krävde minst 20 dödsoffer.
Stenar flög genom luften i Abbassiya-området i Kairo när militärpolis och demonstranter på fredagen drabbade samman kring försvarsdepartementets byggnad. Militären avfyrade varningsskott för att skingra demonstranter. Minst två människor dödades, enligt sjukvårdare på plats.
Ytterligare 296 människor skadades i våldsamheterna, enligt ett uttalande från hälsodepartementet som även uppgav att en värnpliktig soldat dödats.
Armén grep minst 170 personer och nattligt utegångsförbud utfärdades för området kring försvarsdepartementet, mellan klockan 23.00 och 07.00.
Tusentals personer hade under dagen samlats för att demonstrera mot det styrande militärrådet, två dagar efter våldsamheterna i onsdags där minst 20 människor miste livet.
Demonstranterna kritiserade även beslutet att diskvalificera tio av de 23 presidentkandidater som registrerat sig inför presidentvalet.
Militären, som tog över makten i Egypten sedan president Hosni Mubarak i fjol tvingats avgå, har mött växande kritik och anklagelser om våld mot protester, tortyr och tillslag mot kritiker.
